京都大学（KyotoUniversity），与东京大学分处日本东西两方一直以来都是日本国内等同齐名的最高学府。在科学研究方面，京大培育出的人才和成果以说是享誉世界，因而被为“科学家的摇篮”。

东京工业大学（TokyoInstituteofTechnology），是一所以工程技术与自然科学硏究为主的日本顶尖、世界一流的理工科大学。作为研究型大学，东京工业大学在学术研究、科研成果和教育教学等许多方面在世界享有盛誉。

理工科很强，堪称日本的麻省理工，是世界一流的理工科大学。

大阪大学（OsakaUniversity），是世界级著名研究型国立综合大学。，综合实力日本第三，在日本关西地区与京都大学一道在各个领域都起着重要作用。作为日本国内的最高学府之一，大阪大学在全球都享有很高声望。

医学和工学一直走在世界先端，高分子材料都不错，人工智能也不错。

东北大学（TohokuUniversity），位于日本东北地区仙台市，学校涵盖文、理、工、医、农各科专业，是一所日本顶尖、世界一流的研究型综合国立大学，日本东北地方最高学府。

电气通信、生物工学、金属材料都是比较有优势的专业，尤其材料方面，研究实力傲视全球。

名古屋大学（NagoyaUniversity），是一所日本顶尖、世界一流的著名研究型综合国立大学，日本中部地方最高学府。该校现拥有10个学部、15个研究科、3个研究所、2所全国共同利用共同研究基地、29处校内共同教育研究设施。

物理学专业七百稳居前五，工学研究科也十分有实力，诞生过2名诺贝尔奖得主，而且有实力雄厚的丰田公司作为支持

九州大学（Kyushu University），是一所本部位于日本福冈市的世界顶尖超一流综合研究型大学，日本九州地区最高学府，在全球享有极高的声誉。

超导、等离子体，海洋、火山、地震预测，癌的研究。

北海道大学（HokkaidoUniversity），是一所本部位于日本北海道札幌市的世界一流、日本顶尖的著名研究型综合国立大学，日本北海道地方最高学府，旧帝国大学之一，是日本历史最悠久的世界级顶尖国立大学。

传媒、观光人气也很高。化学，地球和海洋科学以及材料科学也是强势专业。拥有日本最好的农学研究科所以农学专业也比较强。

庆应义塾大学（Keio University），是一所世界著名研究型综合大学，也是日本历史上第一所高等教育机构 ，与早稻田大学并称私立双雄。

商科、政法、经济、医学等方面最为突出。

早稻田大学（Waseda University）亚洲最为国际化的大学之一，拥有日本最先进的图书馆，留学生数也位居日本前列，其毕业生人才辈出，世界影响力极为广泛。

政治经济学术院法学学院，文学学院。

一桥大学（Hitotsubashi University），是日本唯一一所专门研究人文社会科学的大学，素有“亚洲小哈佛”之称。自成立以来，一桥一直处于日本创新的最前沿。

一桥大学在 经济学、商学 等传统学科保持着绝对优势，法学领域的研究近些年也相当领先

筑波大学（英文：University of Tsukuba）是日本最古老的大学之一，是日本30％以上的国家研究机构的所在地。

工科比较强，图书馆情报最好，教育学也不错。

教育学极强，为该校名牌学科，综合类院校